产品简介

全转录组是指特定细胞在特定状态下所能转录出来的所有RNA的总和，包括mRNA和非编码RNA（non-coding RNA）。针对非编码RNA的研究主要集中在具有调控作用的miRNA，lncRNA和circRNA。基于二代测序技术的全转录组测序研究，同时分析同一样本中的mRNA，lncRNA，circRNA，miRNA，并且通过两两关联分析、三元关联分析、多元关联分析，使研究内容更加系统化，致力于深入挖掘生命现象背后的转录调控问题。

ceRNA（竞争性内源RNA）机制示意图

Wang Y et al., Trends Genet, 2016

我们的优势

1. 双文库构建：small RNA文库和去核糖体的链特异性文库，烈冰 8年建库经验，保证建库质量；

2. 4种RNA全方位分析：不仅能定量分析已知的lncRNA和miRNA，还能通过Stringtie重建转录本预测新的lncRNA；并通过预测的circRNA进行靶向分析 ，从而得到miRNA-mRNA、lncRNA-miRNA、以及circRNA-miRNA的靶向关系；

3. 数据库全面整合：整合并定时升级生物学领域内公认数据库和靶基因预测算法，如NP Inter、miRBase、RNAhybrid等，保证分析结果紧跟行业前沿；

4. 上游测序+下游验证：客户只需提供细胞，组织或者总RNA，烈冰为您完成从上机测序到数据分析整套服务流程，同时可进行后续qPCR验证。

样本要求

组织样品：

1. 动物组织≥1g；

2. 植物组织≥2g；

3. 细胞样品≥1×10⁶个；

4. 全血≥5mL；

5. 菌体≥10⁶个或≥30mg。

RNA样品：

1. 样品需求量： RNA≥10 μg；

2. 样品浓度：RNA样品≥100 ng/μl；

3. 样品纯度：OD260/OD280在1.8-2.2之间，OD260/OD230≥2，28S/18S≥1，动物样品RIN≥7.0，植物样品RIN≥6.5，RNA无明显降解。

实验流程

      1. 客户样本：细胞量在10⁶以上；

2. 总RNA提取及质控：凝胶电泳质控→Nanodrop质控→Agilent 2200质控；

3. small RNA文库构建：切胶范围10-50bp，单端测序SE50，文库分子18-30bp；

4. 去核糖体文库构建：逆转录后用RNase处理，去除rRNA；

5. 上机测序：烈冰建议选择NovaSeq，双端测序，通量大，碱基精度高，而且成本低，速度快。

数据分析流程