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2021

07-26

二代宏基因组学(Metagenomics),又称元基因组学,是以特定生境中的整个微生物群落作为研究对象,无需分离培养,直接提取环境样本DNA进行测序,研究环境微生物的群落结构、物种分类、系统进化、基因功能及代谢网络等,已广泛应用于微生物领域。三代宏基因组测序是指利用PacBio第三代单分子实时测序技术以特定环境下微生物群体基因组为研究对象,组装出核心菌群的基因组,在分析微生物多样性、种群结构...

2021

09-29

由于病毒及噬菌体序列的特殊性,在实验和分析过程中,不能用常规的测序分析方案对项目进行研究。赛默百合从2020年初开始至今,已经协助客户完成了大量噬菌体及病毒测序项目的研究工作,解决了实验和分析过程中的各种问题,摸索出专为病毒和噬菌体数据进行数据分析的分析系统,目前已经发展为公司的特色项目。

2021

09-29

一、平台       illumina novaseq6000       illumina novaseq6000系统使用Illumina成熟的边合成边测序(SBS)技术产生的数据准确,表现可靠。二、公司特色       illumina novaseq6000是目前二代测序的主流测序机型,技术成熟、成本相对更低。为区分于其他公司的测序服务,公司在保证测序质量及测序数据量的情况下,赛默百合...

2021

09-28

一、平台     Nanopore PromethION二、特色       赛默百合三代Nanopore测序平台,在保证数据质量和数据总量的基础上,特推出极致周期测序服务,从样品DNA质检合格到数据下机,周期控制在10个工作日。

2021

09-28

一、平台       PacBio Sequel II                   Sequel II将推动了整个测序方法学组合从现在的二+三+X转变为三+二+X。Sequel II 大大缩小了试剂成本和通量差距,能够让研发人员可以大规模使用长序列的三代测序对整个基因组进行足够覆盖,足够便宜的Iso-seq+UMI将转录组测序带入绝对定量时代。二、特点      赛默百合三代Pacb...

2021

09-28

一、平台       illumina novaseq6000       illumina novaseq6000系统使用Illumina成熟的边合成边测序(SBS)技术产生的数据准确,表现可靠。二、公司特色       illumina novaseq6000是目前二代测序的主流测序机型,技术成熟、成本相对更低。为区分于其他公司的测序服务,公司在保证测序质量及测序数据量的情况下,赛默百合...

2021

08-12

蛋白质在体内生理状态中大约有300多种翻译后修饰,磷酸化修饰是所有翻译后修饰中功能最为重要,作用最为广泛的,也是研究最为深入的蛋白翻译后修饰之一。蛋白磷酸化和去磷酸化这一对可逆过程作为一种生物体重要的分子调节机制,参与了几乎所有的细胞生命活动的过程,包括细胞的生长增值,发育分化,凋亡坏死和信号传导等等;蛋白质发生异常磷酸化修饰有可能引起癌症,糖尿病,以及多种系统性免疫疾病。服务内容磷酸化蛋白...

2021

08-12

泛素是一种含76个氨基酸的多肽,其中包含7个赖氨酸残基(K),其C端可与底物的赖氨酸形成异肽键,引起底物泛素化。泛素的K11,K29,K48和K63菌能参与形成泛素与泛素之间的异肽键。泛素存在于除真细菌界和古细菌界外的许多不同组织和器官中,进化上非常保守,具有标记待降解蛋白的功能。由泛素控制的蛋白质降解具有重要的生理意义,不仅可以清楚错误的蛋白质,还对细胞周期调控、DNA修复、细胞生长、免疫...

2021

08-12

TMT/iTRAQ是一种可以与多肽样品快速的、无偏倚和灵敏地发生反应的标签试剂,与最先进质谱分析技术的结合,可以实现了更精准、 高通量的定量蛋白质组学。描述原理标签试剂由三部分组成:报告基团、质量平衡基团和肽反应标记试剂基团,形成4种-10种相对分子质量均等量的异位标签。标签试剂是可与氨基酸末端氨基及赖氨酸侧链氨基连接的胺标记同重元素。在质谱图中,任何一种试剂标记不同样本中的同一蛋白质表现为...

2021

08-12

利用高分辨率质谱(LC-MS)对蛋白产物进行定性分析,如表达产物,IP/CO-IP产物等原理蛋白质鉴定原理,是依赖于质谱仪,对肽段和肽段碎裂得到的二级子离子的质量进行测定,然后得到肽段的序列信息和蛋白信息。应用领域蛋白质定性、Co-IP相互作用研究、蛋白质表达谱

2021

08-12

蛋白质组学是以一个细胞、组织内表达的全部蛋白质为研究对象,其具有蛋白质种类复杂多样、丰度范围宽泛等特点。为获得深度覆盖蛋白质表达谱,利用分级方法,根据肽段理化性质的不同将其进行分级操作,降低肽段的复杂程度,提高其鉴定能力。原理提取样品中的总蛋白,经胰蛋白酶酶解成肽段后,根据肽段理化性质的不同将其进行分级操作,分级后的肽段利用液相色谱-串联质谱联用进行鉴定,然后进行数据库搜索。应用领域蛋白质组...

2021

08-12

微生物群落广泛分布在地球上的每个生态系统中,它们的活动影响着自然环境的营养循环、土壤肥力,有机质的分解,以及物质与能量之间的交换。现代分子生物学揭示,自然界中微生物群落及其栖息的环境远比人们预期的复杂和多样,通过纯培养技术在实验室所获取的微生物仅占环境微生物总量的1%左右。宏蛋白质组是从蛋白质水平对给定位点的环境微生物群落的所有蛋白质组成进行大规模分析,可更好的推动对微生物群落的多样性、结构...

2021

08-12

乙酰化修饰功能主要集中在对细胞染色体结构的影响,同时蛋白质的乙酰化修饰不是少数,极可能影响着细胞生理状态下各个方面的广泛修饰。另外蛋白质的乙酰化具有很高的功能特异性——在代谢器官(如肝)中代谢酶被高度乙酰化,而在白血病中参与肿瘤发生的信号通路蛋白也被高度乙酰化。针对这些特点,对不同的疾病或不同的组织功能筛查乙酰化修饰蛋白质图谱,从而有可能以不同的蛋白质修饰特性与特点指导有关疾病临床新药的研发...

2021

08-12

非标定量法(Label-Free)是近年来重要的质谱定量方法,通过比较质谱分析次数或质谱峰强度,分析不同来源样品蛋白的数量变化。该技术无需昂贵的同位素标签做内标,提高了低丰度蛋白质的检测效率和蛋白质定量的准确性,广受科研工作者的推崇。原理非标定量法(Label-Free)是通过比较质谱分析次数或质谱峰强度,分析不同来源样品蛋白的数量变化,认为肽段在质谱中被捕获检测的频率与其在混合物中的丰度成...

2021

08-11

DIA(Data independent acquisition)技术是新一代蛋白质组学分析技术,由蛋白质组学届巨擘Ruedi Aebersold教授开创,是基于质谱的生物样本数字化技术,被Nature Methods杂志评为2015年最值得关注的技术。在蛋白质组学研究领域,基于液相色谱-质谱连用(LC-MS/MS)技术的发现蛋白质组学可在生物样本中检测和相对定量上千个蛋白,在过去十几二十年...

2021

07-30

检测全基因组水平蛋白质和DNA互作CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation, CUT&Tag)是替换传统的ChIP-Seq用以研究DNA与蛋白互作的革新技术。该技术使用磁珠吸附活细胞,digitonin增加细胞膜通透性,利用一抗靶向结合目的蛋白,二抗孵育放大信号,将pA/G-Tn5融合,蛋白与一抗和二抗结合,Mg2+激活Tn5酶活性切割靶...

2021

07-30

RRBS 经济准确高效的甲基化研究简化甲基化测序(Reduced Representation Bisulfite Sequencing,RRBS)通过酶切富集启动子及 CpG 岛区域,并进行 Bisulfite 测序,同时实现 DNA 甲基化状态检测的高分辨率和测序数据的高利用率。作为一种高性价比的甲基化研究方法,简化甲基化测序在大规模临床样本的研究中具有广泛的应用前景。精确度高、重复性好...

2021

07-30

MeRIP-seq 全面高效分析 mRNA 的 m6A 修饰情况RNA甲基化免疫共沉淀 (Methylated RNA Immunoprecipitation,MeRIP)基于 m6A 特异性抗体识别并结合 mRNA 上 m6A 的原理,以 RNA 免疫共沉淀方法富集甲基化修饰片段为基础,并联合高通量测序,研究发生 m6A 甲基化修饰的 mRNA 区域。全面、高效、性价比高RNA 修饰能够在...

2021

07-30

二、ChIP-seq解码蛋白与DNA结合的奥秘ChIP-seq采用特异性抗体对目的蛋白进行免疫沉淀后,分离与其结合的基因组DNA片段,并通过高通量测序,在全基因组范围内寻找目的蛋白特异结合的DNA位点,且可基于多个样品进行差异比较分析及特异蛋白结合位点的序列偏好性分析。平台优,周期短,性价比高。用于在全基因组范围内研究蛋白特异结合的DNA片段,组蛋白修饰和表观遗传修饰的技术,研究这三个主题有...

2021

07-30

宏病毒组病毒宏基因组测序又称宏病毒组(Virome),是在宏基因组学理论的基础上,结合现有的病毒分子生物学检测技术而兴起的一个新的学科分支。 宏病毒组直接以环境中所有病毒的遗传物质为研究对象,能够快速准确的鉴定环境中所有的病毒组成, 是一种发现新病毒、 病毒感染预警和控制的有力手段, 在病毒的起源和进化模式、遗传多样性和地理分布等研究方面也具有重要意义。分析内容:├── samples   ...