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宏基因组测序(二代、三代)


二代宏基因组学(Metagenomics),又称元基因组学,是以特定生境中的整个微生物群落作为研究对象,无需分离培养,直接提取环境样本DNA进行测序,研究环境微生物的群落结构、物种分类、系统进化、基因功能及代谢网络等,已广泛应用于微生物领域。

宏基因组实验室流程.png


三代宏基因组测序是指利用PacBio第三代单分子实时测序技术以特定环境下微生物群体基因组为研究对象,组装出核心菌群的基因组,在分析微生物多样性、种群结构、进化关系的基础上,可进一步探究微生物群体功能活性、相互协作关系及与环境之间的关系,发掘潜在的生物学意义。与二代测序方法相比,三代宏基因组采用PacBio SMRT测序的长读长可以减少部分组装错误,有效提高微生物群落鉴定的分辨率。


分析路线:




宏基因组数据流程分析图.png

分析内容:




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