微生物多样性测序(扩增子测序)


扩增子测序是对特定长度的PCR产物或捕获的片段进行测序,分析序列中的变异。
16S/18S/ITS等扩增子测序即通过提取环境样品的DNA,选择合适的通用引物扩增16S/18S/ITS的目的区域,
通过检测目的区域的序列变异和丰度,以研究环境微生物多样性及群落组成差异。
16S/18S rDNA为编码原/真核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列。
ITS分为两个区域:ITS1位于真核生物rDNA序列18S和5.8S之间,ITS2位于5.8S和28S之间。




信息分析

分析内容=标准分析+高级分析。
基于目的区域的测序,检测序列丰度,以充分研究环境微生物多样性和
群落差异性。







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